日本內閣官房長官菅義偉在11月4日的記者會上，針對小笠原諸島和伊豆諸島周邊的日本專屬經濟區（EEZ）相繼出現中國漁船非法捕撈珊瑚一事稱，「據海上保安廳表示，目前周邊海域確認到超過約200艘外國漁船」。同時透露為加強當地的警戒監視和資訊收集，將向警視廳小笠原警察署增派28名警察。

在伊豆諸島和鳥島周邊進行捕撈的外國漁船（10月31日）

　 菅義偉強調稱：「已在北京通過外交渠道多次要求中國方面採取迅速且有效的應對舉措」。菅義偉表示中國方面表示已認識到事態的嚴重性，正在對漁民進行指導等，同時稱：「希望根據日本國內相關法律認真加以應對」。

　 據日本海上保安廳統計，在小笠原諸島和伊豆諸島周邊海域，截至10月30日有212艘疑似中國船隻出沒，並未出現事態走向平息的跡象。該廳自9月底起啟動「特別應對狀態」，在周邊海域投入大型巡邏艇和飛機，正在加強取締。日本公明黨4日成立了討論珊瑚非法捕撈對策的工作組。
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