熊本地震受災情況的擴大，有可能對日本首相安倍晉三的政權運作産生影響。目前採取最優先應對地震的方針，擱置了原定4月17日舉行的眾議院補選的助選活動，此外，是否出席跨太平洋經濟合作協定（TPP）的國會審議也變得微妙。安倍表示「預計災區的避難將長期化」。有觀點認為將對是否實行眾參兩院同日選舉的判斷産生影響。

　 安倍率領的執政黨自民黨幹事長谷垣禎一、公明黨幹事長井上義久16日在自民黨總部舉行會談，確認了全力支援政府應對災害的方針。雙方就國會審議將在不給首相增加負擔的範圍內推進達成了一致。此外，日本最大在野黨民進黨幹事長枝野幸男16日也通過電話對谷垣表示，「包括國會審議的日程在內，將最大限度予以協助」。

　 不過，在野黨打算阻止本屆國會通過TPP批准案。審議日程已出現「走鋼絲」的情況，如果18日無法審議，在本屆國會通過「將不僅僅是情況嚴峻的問題了」（執政黨高官）。

　 自民黨國會對策委員長佐藤勉16日在宇都宮市內的黨會議上針對TPP審議表示，「下周或將不得不作出各種判斷」。

　 安倍緊急取消了對展開激戰的北海道第5區補選的自民黨候選人的助選。由於安倍中止16日去熊本災區視察，為避免「重視選舉」的批評，將重新考慮能否前往北海道。
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